L’écusson de l’AEK Larnaca est un bouclier vert et jaune divisé verticalement, avec les initiales “ΑΕΚ” empilées sur le côté gauche et l’année 1994 en bas. Le grand champ jaune montre une figure verte casquée, dessinée dans un style classique.
Cette figure représente Kimon, le général athénien traditionnellement lié à l’ancienne Kition, la cité qui se trouvait sur le site de l’actuelle Larnaca. Le nom complet du club, Athlitiki Enosi Kition Larnacas, fait lui aussi référence à Kition, faisant de l’emblème un lien direct entre le club de football et l’identité antique de la ville.
L’AEK Larnaca a été fondé en 1994 par la fusion de deux clubs historiques de Larnaca, EPA Larnaca et Pezoporikos. La palette verte et jaune reflète la nouvelle identité de club issue de cette fusion.
